Una giovane maga sta raccogliendo gioielli per i suoi poteri magici in una foresta magica buia e cupa. Deve raccogliere gioielli magici che contengono elementi come fuoco, terra, acqua e tuono. Devi aiutarla a raccogliere questi gioielli, ma hai solo 100 mosse per completare tutti gli obiettivi. Con ogni obiettivo completato, guadagnerai un livello e otterrai più punti. Jewel Mysteries è un gioco basato principalmente sul punteggio più alto, con obiettivi e mosse limitate. Devi rimuovere i gioielli cliccando su gruppi di 3 o più gioielli. Se fai una combo consecutiva di 7, entrerai nella modalità BURST dei gioielli. Nella modalità BURST dei gioielli guadagnerai il doppio dei punti.